Atlas is een extra project voor leerlingen uit de onderbouw die meer uitdaging nodig hebben en die zich vervelen tijdens de lessen. Ze werken naast hun reguliere lessen aan een zelfverzonnen project. Dat doen ze tijdens de lessen. Minimaal 2 keer en maximaal 4 keer per week mogen zij een les missen om aan het project te werken.

In dit project ruil je lessen in die je kunt missen om een zelfgekozen onderzoek, ontwerp of ander product te maken. Je bent vrij in je keuze, maar elk jaar is er wel een thema waar je eindproduct iets mee te maken heeft. Zo werk je van januari tot en met mei met alle andere Atlantiden aan een gezamenlijke eindvoorstelling waar je je eigen rol hebt. Alle ouders en belangstellenden zijn dan uitgenodigd en lopen rond over een soort markt. Het thema wisselt jaarlijks. Wanneer je meerdere jaren meedoet, is er telkens een andere uitdaging. Om in de stemming te komen voor de nieuwe presentatie ga je met de hele groep een dag op excursie.